Índice: Species (currently accepted name)
- Jacobaea auricula (Bourg. ex Coss.) Pelser (6)
- Jacobaea maritima subsp. sicula N.G.Passal., Peruzzi & Pellegrino (1)
- Jacobaea paludosa (L.) G.Gaertn., B.Mey. & Scherb. subsp. angustifolia (Holub) B.Nord. & Greuter (4)
- Jacobaea paludosa subsp. lanata (Holub) B.Nord. & Greuter (1)
- Jasione montana L. (1)
- Jasminum azoricum L. (2)
- Juncus acutiflorus Ehrh. ex Hoffm. (1)
- Juncus conglomeratus L. (2)
- Juncus effusus L. (1)
- Juncus gerardi Loisel. (1)
- Juncus squarrosus L. (1)
- Juniperus canariensis Guyot (1)
- Juniperus cedrus Webb & Berthel. (8)
- Juniperus communis L. (20)
- Juniperus excelsa M.Bieb. (2)
- Juniperus foetidissima Willd. (2)
- Juniperus macrocarpa Sm. (8)
- Juniperus oxycedrus L. (1)
- Juniperus phoenicea L. (1)
- Juniperus turbinata Guss. (3)
- Jurinea micevskii Stevan., Matevski & Kit Tan (1)